علي مطهري اگرچه در چندسال گذشته به منتقد جدي دولت‌هاي نهم و دهم به رياست محمود احمدي نژاد تبديل شده است و بارها در مجلس با سرسختي مقابل آنها ايستاده است، اما بدون ترديد وي يکي از مهم ترين منتقدان مجلس‌هاي هفتم، هشتم و اکنون نهم نيز بوده است.   به نوشته روزنامه ابتکار عدم قاطعيت در برابر دولت و ناکارآمدي در استفاده از اهرم نظارتي مجلس بر دولت که در ماجراي بازپس گيري‌هاي متعدد استيضاح وزرا خود را نشان مي‌دهد، از جمله مواردي است که وي به آنها معترض است. استيضاح نصف و نيمه وزير ورزش در روز يکشنبه جاري دستمايه تازه ترين انتقادات وي از مجلس و به خصوص رئيس آن علي لاريجاني شده است.   اين نماينده مردم تهران در مجلس در گفت وگو با فرارو درباره اتفاقات روز يکشنبه مجلس گفت: «اتفاقي که در جلسه روز يکشنبه مجلس درباره استيضاح وزير ورزش و جوانان روي داد، اتفاق بدي بود و به نظر من مقداري به اقتدار مجلس آسيب زد.»وي ادامه داد: «من مقصر اصلي اين اتفاق را هيات رئيسه مجلس مي‌دانم که تا اين ميزان مي‌خواهند در کار يک استيضاح دخالت کنند.»وي افزود: «وقتي حداقل ده نفر از نمايندگان، استيضاح يک وزير را امضاء مي‌کنند، قبل از آنکه توسط هيات رئيسه اعلام وصول شود و حتي بعد از آن هيچ اشکالي ندارد که جلسه‌اي با وزير مربوط تشکيل داده و مسائل خود را مطرح کنند و اگر قانع شدند امضاي خود را پس بگيرند.»   وي افزود: «اساسا معني ندارد وقتي که استيضاح آغاز شد بخواهند به دنبال پس گرفتن امضاها باشند و يک فضايي ايجاد کنند که نماينده فکر کند شايد يک مسئله بزرگ امنيت ملي در ميان است که اين مقدار فشار مي‌آورند و در اين شرايط، آن نماينده هم ملاحظه مي‌کند و ممکن است امضاي خود را پس بگيرد.»   مطهري با بيان اينکه اين کار نوعي بي‌احترامي به نمايندگان محسوب مي‌شود گفت: «امضاي نمايندگان ارزش دارد و بالاخره وقتي ده نماينده طرح را امضا کردند بايد به آنها احترام گذاشت.»وي اظهار کرد: «ممکن است هيات رئيسه و حتي اكثريت مجلس طرح يك استيضاح را به صلاح ندانند. در اين صورت حداکثر اين است که مجلس به استيضاح راي نمي‌دهد؛ ولي حقايقي مطرح مي‌شود و نمايندگان و مردم مي‌شنوند و اين امر به حال كشور مفيد است و از همه مهمتر اين كه قانون اجرا شده است.»وي تاکيد کرد: «اين که تا اين ميزان مسئله را سياسي کنيم، اساسا کار درستي نيست.»   مطهري درباره پس نگرفتن امضاي خود از طرح استيضاح عباسي گفت: «من جزو امضاكنندگان اوليه استيضاح وزير ورزش و جوانان نبودم و آن را در اولويت نمي‌دانستم؛ اگرچه وزير را ضعيف مي‌دانستم. منتهي روز استيضاح وقتي ديدم يک فشار غيرمعمولي بر نمايندگان وارد مي‌کنند و تلاش دارند كه تعداد امضاها از حد نصاب بيفتد و گفتند يکي دو امضاء کم است و آقاي كامران از من درخواست امضا كرد، من براي آنکه آبروي مجلس حفظ شود و مجلس متهم به تزلزل و عقب‌نشيني نشود اين طرح را امضاء کردم.»مطهري گفت: «متاسفانه هيات رئيسه و شخص آقاي لاريجاني خيلي متزلزل رفتار کردند. مقداري به مسائل، سياسي نگاه مي‌شود و مثلا مي‌گويند اگر اين استيضاح را اکنون مطرح کنيم، رسانه‌ها مي‌گويند مجلس مسئله اصلي کشور را که اقتصاد باشد کنار گذاشته و سراغ يک مسئله فرعي رفته است.    بنابراين به خاطر آنکه مجلس فعلا مورد حمله واقع نشود اين مسئله را رها کنيم، در حالي كه عمل به قانون آيين‌نامه داخلي مجلس مهمتر از اين حرفهاست.»   مطهري درباره دلايل پس گرفتن امضاها از سوي برخي نمايندگان در جريان استيضاح وزير ورزش گفت: «همان طور که گفتم فضايي که ايجاد مي‌کنند، هم از سوي دولت و هم از سوي هيات رئيسه مجلس، به گونه‌اي است كه نماينده را مردد و متزلزل مي‌كند. مديران منطقه‌اي و معاونان پارلماني دولت از يك طرف و برخي اعضاي هيات رئيسه مجلس از طرف ديگر نماينده را تحت فشار قرار مي‌دهند.»   وي ادامه داد: «يعني هجوم عجيبي به نماينده مي‌آورند و نماينده هم فکر مي‌کند اکنون در حال انجام يک اقدام ضد امنيت ملي است و لذا کار را رها مي‌کند. در حالي که همان طور که عرض کردم حداکثر اين است که جلسه‌اي با وزير تشکيل مي‌دهند و اگر قانع شدند رها مي‌کنند و گرنه استيضاح را به جريان مي‌اندازند و ديگر اين همه کش و قوس واقعا معني ندارد.»